6月16日0—24時，31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增確診病例54例。其中境外輸入病例31例（福建10例，廣東7例，上海3例，陜西3例，北京2例，四川2例，浙江1例，湖北1例，湖南1例，重慶1例），含2例由無癥狀感染者轉為確診病例（浙江1例，廣東1例）；本土病例23例（北京11例，內蒙古6例，遼寧4例，上海2例），含2例由無癥狀感染者轉為確診病例（北京1例，內蒙古1例）。無新增死亡病例。無新增疑似病例。
當日新增治愈出院病例51例，其中境外輸入病例16例，本土病例35例（上海21例，北京9例，四川3例，遼寧2例），解除醫學觀察的密切接觸者16033人，重癥病例較前一日減少5例。
境外輸入現有確診病例236例（無重癥病例），無現有疑似病例。累計確診病例19006例，累計治愈出院病例18770例，無死亡病例。
截至6月16日24時，據31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告，現有確診病例951例（其中重癥病例10例），累計治愈出院病例218995例，累計死亡病例5226例，累計報告確診病例225172例，無現有疑似病例。累計追蹤到密切接觸者4203286人，尚在醫學觀察的密切接觸者108407人。
31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增無癥狀感染者103例，其中境外輸入62例，本土41例（內蒙古13例，北京11例，吉林6例，遼寧5例，上海2例，河北1例，廣西1例，四川1例，云南1例）。
當日解除醫學觀察的無癥狀感染者251例，其中境外輸入68例，本土183例（上海143例，遼寧12例，浙江8例，北京7例，四川7例，內蒙古2例，廣東2例，吉林1例，廣西1例）；當日轉為確診病例4例（境外輸入2例）；尚在醫學觀察的無癥狀感染者1652例（境外輸入464例）。
累計收到港澳臺地區通報確診病例3469863例。其中，香港特別行政區334215例（出院63056例，死亡9392例），澳門特別行政區83例（出院83例），臺灣地區3135565例（出院13742例，死亡4714例）。
